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“调律舟”的存在及其危险实验的推断，如同投入油锅的冰水，在冯远山衙门与西苑“录档房”同时激起了剧烈反应。
冯远山当机立断，一面以八百里加急将最新情势密报朝廷，一面越过常规程序，直接向郑参将下达了最高级别的密令：“放弃对荷兰残部之监视与对峙，集中一切可调动之精锐力量，以搜寻、确认并严密监视那艘古式怪船为当前唯一要务。若确认其有危险举动，或捕捉到其试图再次‘调谐’能量场之迹象，可不受‘不得擅启边衅’之限，酌情采取断然措施予以阻止或摧毁，唯务必确保行动隐蔽、突然，避免引发大规模能量扰动。若遇抵抗，格杀勿论。所需额外船只、人手、火器，本官即刻调配。”
这是将“聆音者”的威胁提升到了最高级别，甚至不惜暂时搁置与荷兰人的对抗，并授权前线指挥官在极端情况下采取先发制人的攻击。冯远山知道这有违朝廷“谨慎处理、避免扩大事端”的总体方针，但苏瑾的警告和雷百户的描述，让他意识到这已非普通的外交摩擦或自然灾害，而是一场可能由人为技术引发的、更具毁灭性且目的性明确的超常危机。
同时，他也通过隐秘渠道，恳请苏瑾利用其民间网络，从其他方向（如港口流言、可疑人员踪迹、特殊物资交易等）协助调查“聆音者”的背景与可能的同伙。
西苑，温觉在接到苏瑾和冯远山的紧急报告后，立刻面圣。他将“调律舟”、“聆音者”、能量场被主动干预试验以及拉斐尔的供词，条分缕析地呈报给皇帝。
皇帝的脸色在烛光下显得晦暗不明。“星芒会余孽，竟有此等手段？”他声音低沉，“意图操控天威，其心可诛。冯远山处置，虽有僭越，然事急从权。准其所请，着其务必谨慎行事，一击必中，勿使贼人走脱，亦勿再酿大祸。另，‘录档房’圣物研究，进度如何？能否反制此等‘调谐’之术？”
温觉答道：“圣物研究已有眉目。‘黑髓’确能感应‘场’之变化，羊皮卷纹路经破译，似为某种引导能量流动或聚焦之‘图谱’。然主动‘调谐’乃至‘反制’，所需知识与控制力远超当前，强行尝试风险极大。眼下或可先尝试以圣物为‘探测器’，更精准地捕捉‘调律舟’活动之‘频率’与‘模式’，为冯远山之行动提供指引，并尝试预测其下一步可能‘拨动’之‘弦’，以便预警或干扰。”
皇帝沉吟片刻：“准。命‘录档房’即行此策，然务必将圣物异动控制在最低限度，绝不可使其成为新的‘引信’。另，通告东南各省及沿海水师，加强戒备，若有形制可疑、行踪诡秘之船只人员，一经发现，立即扣押查问，宁可错抓，不可放过。”
一场针对“聆音者”的秘密猎杀与反制行动，在最高层的默许与授权下，迅速展开。
海上，郑参将在接到冯远山密令后，精神大振。他终于不用再纠结于与荷兰人的对峙，可以集中力量对付那真正的威胁。他立刻重新部署：将大部分尚有战力的船只编成数个搜索与监视小队，由经验最丰富的军官带领，轮流、隐蔽地对以“调律舟”出现的暗礁区为中心，辐射数十里的海域进行拉网式搜索和定点监视。他特别挑选了几艘最灵活、配备有最强火器（如改良过的火铳和少量喷筒）的快船，组成一支精干的“突击队”，由雷百户指挥，随时待命，一旦发现“调律舟”有异动或得到确切断线命令，便立刻发起突击。
胡舵工、陈五等技术观测人员，也被要求将监测重点完全转向对“调律舟”可能活动的迹象捕捉上。他们在几个关键位置的观测点架设了改进过的监听和磁力设备，并与郑参将的指挥船建立了直接的信号联系（使用特制的彩色信号旗和铜钟组合，以应对复杂电磁环境对远程通讯的持续干扰）。
范·德·维尔德敏锐地察觉到了明军动向的变化。原本如影随形的监视压力骤然减轻，明军船只开始频繁向东南方向某个区域集结、搜索，气氛紧张而专注，完全无视了荷兰残船的存在。
“他们找到了更重要的目标。”范·德·维尔德对副手们说，“看他们的架势，像是要围猎什么。难道这片海域里，除了我们和那海底怪物，还有别的‘东西’？”他想起了之前了望员报告的、一闪即逝的神秘古船影子，以及自己日志里记录的种种“奇异现象”。
他心中疑虑重重，但更多的是松了口气。明军转移注意力，给了他宝贵的喘息和修复船只的机会。他命令手下加快对“海狼”号的紧急修补，同时派出小艇，在确保安全的前提下，朝着明军搜索区域的相反方向（即他们认为的撤离路径）进行更远距离的侦察，准备一旦“海狼”号能勉强航行，便立刻拖拽其离开这片是非之地。对于明军的异动和可能存在的“第三势力”，他决定将所见所闻详细记录，留待日后向总督报告，而非此刻介入。
在郑参将和“聆音者”都未察觉的暗处，苏瑾的“青鸾”网络也在悄然运转。数名精干人员伪装成渔民、行商甚至落魄书生，开始在各处港口、市镇打探。他们重点关注近期是否有形貌奇特（非中土亦非常见西洋、南洋人）、沉默寡言、购买或转运特殊物品（如特定矿物、罕见药材、不明用途的金属构件）的外来者。很快，几条模糊的线索浮出水面：约两个月前，有操古怪口音、衣着类似僧侣但样式奇特的数人，曾在泉州港外一处偏僻渔村短暂租住，收购过一批品质极高的磁石和某种产自内陆的稀有蓝黑色矿石；约一月前，有小型货船从吕宋方向运来一批密封极严的木箱，在福州外海未进港便被小艇接走，接货者船只形制不明；此外，沿海几个县的药铺，都曾有人高价求购过几种常用于镇定安神或治疗癫狂的药材，数量不小。
这些线索虽然零碎，且无法直接指向“调律舟”，但拼凑起来，勾勒出一股有计划、有资源、行事隐秘的外来势力在东南沿海活动的大致轨迹，与“聆音者”可能的行为模式高度吻合。苏瑾将这些情报整理后，即刻密送冯远山和温觉。
就在这多方角力、暗流汹涌之际，“调律舟”似乎也察觉到了危险的迫近，或者，是它的“调音”实验进入了更关键的阶段。
灾后第十四日，凌晨。浓雾再起。陈五在礁岛观测点值夜。连续数日的紧张监视，让他疲惫不堪，但职责所在，他仍强打精神，守在那具简陋但经过改进的“声波定向听筒”前。
突然，听筒中传来的、已经习惯了的低沉“潮音”和断续“尖细杂音”中，混入了一种新的、极其规律且富有穿透力的“嗡——嗡——”声，如同有人用弓弦在反复拉奏一个固定的低音，节奏稳定得令人心悸。几乎同时，设置在旁边的磁力计指针猛地一跳，然后开始以一种前所未有的、平滑而快速的圆周运动旋转起来！