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真假格格真相曝光后，小燕子、紫薇和金锁被打入宗人府大牢。

皇后与容嬷嬷借机报复，暗中吩咐狱卒百般苛待三人，牢中环境阴暗潮湿，三人受尽折磨，处境凄惨危险。

宫外，永琪、尔康、尔泰心急如焚，屡次入宫求情，可盛怒的乾隆皇帝态度坚决，丝毫不予松口。

与此同时，塞娅公主坚持非尔康不嫁，和亲赐婚的压力压得众人喘不过气。

为彻底解救危机，尔泰决定来一出美男计，主动接近性格爽朗的塞娅，陪她比武游玩，温柔耐心地陪伴左右，慢慢打动塞娅的心，成功让塞娅移情于自己，化解尔康的危机。

[哈哈哈，关键时刻还是弟弟靠得住]

[福伦大学士：我的官职、我的帽子、我的儿子、我的九族……都保住了]

[还好尔泰没有官配，不然这一次就死定了]

[说实话尔康要是抗旨不尊的话，这部剧就有些离谱了，为了自己的爱情，全族人的命都不是命了吗]

[没想到尔泰居然是最最关键的一环]

[美男计还真不错，要我是个公主，每天有个温柔帅气的男子陪着我玩儿，另一个对我不情不愿的，我也选前面的]

……

牢中危机未解，众人不愿坐以待毙，永琪、尔康下定决心铤而走险，联合柳青、柳红深夜闯狱，假借圣旨骗过狱卒，成功救出小燕子三人。

犯下劫狱、假传圣旨的滔天大罪后，众人深知大祸临头，只能收拾行装，连夜逃离京城，踏上亡命天涯的逃亡之路。

一行人连夜逃亡，一路躲避官兵追捕，颠沛流离、惊险万分。众人患难与共，两对恋人的感情愈发坚定，彼此许诺生死不离。

可一路逃亡途中，众人心中始终牵挂皇宫、牵挂皇上，不愿一辈子背负逃犯罪名、颠沛流离度日。几经挣扎抉择，众人最终毅然决定放弃逃亡，主动折返皇宫认罪，坦然承担所有过错。

[我的天，这什么走向啊？我都想好他们会隐姓埋名，结果居然自投罗网了]

[回去了？脑袋不要了]

[不愿意颠沛流离，所以愿意被砍头是吗]

[好莫名其妙，要是这样那你们前面劫法场干嘛]

[也能理解，如果要一辈子做逃犯的话，还不如自首呢]

[回去了，大不了也就一死，但不回去的话，这辈子估计都要过这样担惊受怕的日子了]

[主动认错，说不定趁皇帝对他们还有点感情，能争取宽大处理，时间久了就真成反贼了]

[虽然最后尔康没有抗旨，但他还不如抗旨呢，尔泰真是白努力了]

……

一行人重回皇宫认错，大殿之上，皇后咄咄逼人，罗列众人欺君、劫狱、抗旨的重罪，极力恳请乾隆皇帝将众人全部处死。

危急关头，紫薇强忍委屈，声泪俱下地讲述夏雨荷痴情等待一生的凄苦往事，句句真心、字字泣血，彻底触动乾隆内心。

乾隆忆起过往点滴，感念紫薇舍身救驾的恩情，也觉得皇后有些心狠了。加上令妃、福伦、纪晓岚等人接连求情，乾隆终于放下怒火，选择宽恕众人。

他正式认下紫薇为亲生女儿，册封明珠格格，保留小燕子还珠格格封号，成全永琪小燕子、尔康紫薇的恋情，同时赐婚尔泰与塞娅。